Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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