Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BrafP28028 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BrafP28028 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BrafP28028 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BrafP28028 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms