Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms