Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U2af2P26369 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms