Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CftrP26361 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CftrP26361 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CftrP26361 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CftrP26361 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms