Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms