Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18532 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18532 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms