Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms