Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd5P13379 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms