Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp1P11103 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp1P11103 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp1P11103 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms