Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P10404 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P10404 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms