Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm3P0DP28 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms