Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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