Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01649 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01649 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01649 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01649 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P01649 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01649 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01649 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms