Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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