Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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