Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms