Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ColqO35348 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ColqO35348 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ColqO35348 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms