Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1aO35134 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms