Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms