Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms