Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms