Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tmem200cJ3QK46 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms