Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms