Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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