Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3371F7CQW8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3371F7CQW8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms