Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm28048F7BCN0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm28048F7BCN0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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