Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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