Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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