Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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