Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms