Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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