Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zscan18E9PUD6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms