Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms