Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc6D3YZP9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms