Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms