Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms