Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Prr16A3KMN5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Prr16A3KMN5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Prr16A3KMN5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Prr16A3KMN5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Prr16A3KMN5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Prr16A3KMN5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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