Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AgrnA2ASQ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AgrnA2ASQ1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms