Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms