Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms