Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms