Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms