Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn4Q9WU22 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn4Q9WU22 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn4Q9WU22 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms