Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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