Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubxn8Q9QZ49 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubxn8Q9QZ49 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubxn8Q9QZ49 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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