Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms