Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfra4Q9JJT2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms