Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms