Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms